软件介绍
分子模拟器APP简介
分子模拟器是一款功能强大的安卓应用，它专为科研人员和化学爱好者设计，提供了图形显示、分子建模、分子对接和分子动力学模拟等综合性功能。这款软件由奥地利的elmar krieger在1993年开发，其名称yasara来源于“yet another scientific artificial reality application”的缩写，寓意科学与艺术的完美结合。yasara不仅具有艺术级别的显示界面，其内核还采用了高效的pvl框架，使得软件能够处理大量蛋白结构并进行交互式的分子模拟操作。
分子模拟器APP亮点
高性能内核：yasara采用了pvl框架，相比传统软件具有更高的性能，能够迅速打开和处理大型pdb文件，速度提升可达50倍以上。
兼容性强：软件支持超过70种分子文件格式，包括常见的pdb、mol2、sdf等，以及量子化学程序的输出文件，如adf、gaussian等。
用户友好界面：默认的蓝色渐变背景设计不仅增强了蛋白三维结构的层次感，还减轻了长期使用用户的视力疲劳。同时，软件支持一键切换分子显示模式，极大提高了操作效率。
分子模拟器APP特色
分子建模：用户可以通过yasara的结构构建模块，在几秒钟内手动搭建出复杂小分子/多肽的三维结构，并利用autosmiles工具对分子结构进行初步优化。
分子对接：软件支持精准分子对接、全柔性受体-配体对接以及分子对接后的构象分析，帮助用户找到配体与受体之间的最佳结合模式。
数据分析：yasara可以一键分析蛋白-蛋白、蛋白-配体之间的相互作用，如氢键、疏水作用等，并计算分子表面和溶剂可及表面，展示分子空腔结构。
分子模拟器APP优势
艺术级显示界面：yasara的显示界面设计独特，不仅美观而且实用，为用户提供了极佳的操作体验。
多功能集成：软件集成了分子建模、分子对接、分子动力学模拟和虚拟筛选等多种功能，满足了科研人员在分子模拟方面的多样化需求。
高效数据处理：yasara能够迅速处理大型分子结构数据，提供快速且准确的模拟结果，有助于科研人员快速推进研究进程。
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